L’applicazione di un Amplatzer Septal Occluder è una procedura a basso rischio di complicanze quasi esclusivamente limitate alla zona di introduzione del dispositivo , che generalmente è la vena femorale destra. Una profilassi antibiotica è in grado di prevenire possibili endocarditi. Successivamente all’intervento è utile praticare terapia antiaggregante piastrinica. La durata della procedura è di circa un’ora o due e generalmente sono necessari un paio di giorni di ricovero.