La TAO riduce notevolmente, ma purtroppo non abolisce del tutto il rischio di ictus. Quando questo accade va verificato innanzitutto se i valori di INR sono sempre stati nel range di efficacia e quindi vanno ricercate altre cause di ictus non emboliche (ad esempio una trombosi carotidea). In ogni caso, a seguito di un ictus durante TAO di solito si prende in considerazione il potenziamento del trattamento con aggiunta di aspirina.